El crucifijo del perdón tiene en el mismo la Medalla de la Virgen Milagrosa y la medalla de San Benito. El Papa San Pío X usó las llaves del cielo y ató este sacramental del Crucifijo del Perdón, con ricas indulgencias, cosa que Satanás odia.
En el frente del crucifijo, sobre el cuerpo, están las palabras "Jesús Nazarenus Rex Judaeorum". La traducción es "Jesús de Nazaret, el rey de los judíos".
En la parte posterior de la cruz está el Sagrado Corazón y dos inscripciones. La primera en la porción horizontal es la oración de perdón que le da a este crucifijo su nombre, "Padre, perdónalos". En la parte vertical de la parte posterior están las palabras que Jesús pronunció a Santa Margarita María en 1675, "He aquí este corazón que tanto ha amado a los hombres". Al pie de la cruz, también en la parte posterior, se encuentra el símbolo de María.